Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC192P0DO97 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms