Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RD3LP0DJH9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms