Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDYNP01213 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDYNP01213 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDYNP01213 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDYNP01213 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDYNP01213 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDYNP01213 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDYNP01213 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDYNP01213 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms