Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP2O94887 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP2O94887 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP2O94887 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP2O94887 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP2O94887 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP2O94887 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FARP2O94887 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms