Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.593e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 XPA-204ENST00000496104 429 ntTSL 35.03□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RASGRP1-208ENST00000558432 2895 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATAD2B-206ENST00000474583 3765 ntTSL 24.99□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PIK3R4-204ENST00000508273 817 ntTSL 34.97□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NAPEPLD-206ENST00000422589 2672 ntTSL 1 (best)4.96□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OSBPL10-214ENST00000479173 554 ntTSL 44.96□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBM22-208ENST00000522469 989 ntTSL 24.96□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TFAM-203ENST00000395377 663 ntTSL 24.95□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CWF19L1-205ENST00000473842 654 ntTSL 54.92□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 THOC5-217ENST00000492707 550 ntTSL 34.92□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC41A2-209ENST00000449866 574 ntTSL 44.92□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATR-209ENST00000515810 553 ntTSL 34.91□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 24.91□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATXN1-208ENST00000492857 647 ntTSL 44.91□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AKT2-231ENST00000578310 158 ntTSL 34.86□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDR2-203ENST00000563573 556 ntTSL 44.85□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALG13-208ENST00000470704 536 ntTSL 24.81□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FCF1-206ENST00000554590 574 ntTSL 44.81□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NIPBL-205ENST00000505998 969 ntTSL 54.8□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.78□□□□□ -1.642e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.653e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRIM2-203ENST00000419977 2197 ntTSL 24.7□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIF21A-213ENST00000552961 4120 ntTSL 1 (best)4.69□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PIK3R4-207ENST00000512430 579 ntTSL 34.69□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ASCC1-214ENST00000530394 839 ntTSL 54.68□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 24.67□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUMB-220ENST00000556112 568 ntTSL 44.63□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-208ENST00000415569 2780 ntTSL 54.59□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EVI5-203ENST00000468580 654 ntTSL 54.57□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PROSER1-210ENST00000602899 574 ntTSL 34.56□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-205ENST00000392871 2352 ntTSL 24.54□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 YTHDC2-203ENST00000506333 784 ntTSL 54.52□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PGR-AS1-201ENST00000531772 429 ntTSL 24.49□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PROSER2-AS1-202ENST00000453242 475 ntTSL 34.49□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GLA-203ENST00000468823 619 ntTSL 54.49□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SIPA1L3-203ENST00000594553 374 ntTSL 34.47□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GON4L-213ENST00000488251 779 ntTSL 34.46□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-213ENST00000479879 565 ntTSL 54.34□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBE2Q1-204ENST00000476612 301 ntTSL 34.33□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ELMO2-215ENST00000481852 717 ntTSL 44.32□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA1109-206ENST00000424425 3741 ntTSL 24.3□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.28□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-217ENST00000484303 984 ntTSL 34.26□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BMPR1A-204ENST00000636056 3233 ntTSL 54.25□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BCAS3-228ENST00000592393 569 ntTSL 54.24□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DLD-210ENST00000478414 549 ntTSL 44.21□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 54.17□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CD55-208ENST00000476590 2163 ntTSL 1 (best)4.16□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DLD-212ENST00000489184 638 ntTSL 24.15□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ADNP-205ENST00000534467 773 ntTSL 34.13□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-212ENST00000582354 1019 ntTSL 54.12□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-218ENST00000491448 2456 ntTSL 54.11□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAX8-AS1-220ENST00000624706 434 ntTSL 54.07□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZMYND11-213ENST00000488275 581 ntTSL 24.06□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LCMT1-AS1-201ENST00000563176 432 ntTSL 54.05□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-205ENST00000463890 575 ntTSL 54.04□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP350-201ENST00000357434 392 ntTSL 1 (best)4.03□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OFD1-205ENST00000464463 812 ntTSL 34.01□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SPDL1-204ENST00000505977 936 ntTSL 53.97□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB38-217ENST00000513258 591 ntTSL 43.97□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATRX-203ENST00000400866 814 ntTSL 53.96□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RAD51AP1-209ENST00000538817 581 ntTSL 43.92□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GON4L-208ENST00000468867 471 ntTSL 33.92□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP83-213ENST00000551596 631 ntTSL 33.9□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EVI5-205ENST00000491940 971 ntTSL 53.89□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UGP2-209ENST00000472047 558 ntTSL 43.87□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MORC3-204ENST00000485933 417 ntTSL 53.84□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 137.9
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