Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QW42 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QW42 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QW42 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QW42 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QW42 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QW42 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QW42 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QW42 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QW42 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms