Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GOLGA6L9A6NEM1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms