Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms