Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHDC2Q9Y2U9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms