Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms