Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRPS1Q9UHF7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms