Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPG2Q9UBF2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms