Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms