Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf78Q9NZ63 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf78Q9NZ63 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms