Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DNAJC28Q9NX36 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms