Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PNPLA3Q9NST1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms