Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF275Q9NSD4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms