Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.429e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RBMS2-205ENST00000551369 552 ntTSL 46.15□□□□□ -1.427e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ST6GAL1-202ENST00000416235 577 ntTSL 26.15□□□□□ -1.427e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RNF217-208ENST00000519799 450 ntTSL 46.09□□□□□ -1.431e-21■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EFCAB13-208ENST00000520776 1979 ntTSL 26.02□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-243ENST00000636541 527 ntTSL 56.02□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 XRRA1-211ENST00000529926 542 ntTSL 26.02□□□□□ -1.459e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-213ENST00000585970 487 ntTSL 35.99□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BCS1L-220ENST00000493376 550 ntTSL 25.94□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CEP350-205ENST00000429851 6096 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ESRRG-215ENST00000471371 3171 ntTSL 1 (best)5.92□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TPD52-216ENST00000520877 576 ntTSL 45.91□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TCF12-211ENST00000559216 475 ntTSL 45.9□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF468-204ENST00000597924 533 ntTSL 45.89□□□□□ -1.477e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 35.79□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DYM-214ENST00000582399 366 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-210ENST00000556078 449 ntTSL 35.71□□□□□ -1.57e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TYW3-208ENST00000486467 551 ntTSL 35.64□□□□□ -1.517e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.527e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-214ENST00000555851 502 ntTSL 55.35□□□□□ -1.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GAD1-213ENST00000486850 461 ntTSL 35.33□□□□□ -1.567e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-234ENST00000631026 914 ntTSL 55.32□□□□□ -1.567e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 35.31□□□□□ -1.561e-16■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-208ENST00000554882 3748 ntTSL 55.3□□□□□ -1.567e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.587e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 25.14□□□□□ -1.597e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.597e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.617e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MAP2K5-206ENST00000557869 412 ntTSL 34.92□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-255ENST00000637754 100 ntTSL 54.9□□□□□ -1.637e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.637e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-209ENST00000508871 5707 ntTSL 1 (best)4.81□□□□□ -1.647e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PTPRM-204ENST00000577468 701 ntTSL 34.7□□□□□ -1.667e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MTO1-216ENST00000521156 886 ntTSL 24.67□□□□□ -1.667e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CEP350-209ENST00000490141 3549 ntTSL 24.67□□□□□ -1.667e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 QTRT2-210ENST00000482307 449 ntTSL 54.64□□□□□ -1.677e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.787e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FRYL-206ENST00000503339 3482 ntTSL 23.7□□□□□ -1.827e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.847e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF28-208ENST00000596559 628 ntTSL 53.43□□□□□ -1.867e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-204ENST00000503468 6339 ntTSL 1 (best)3.17□□□□□ -1.97e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.967e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-250ENST00000637506 100 ntTSL 51.68□□□□□ -2.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-251ENST00000637531 100 ntTSL 50.9□□□□□ -2.277e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DNM1-205ENST00000463998 871 ntTSL 416.06■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 186.2
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 185.9
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 185.9
UTP3Q9NQZ2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 185.9
UTP3Q9NQZ2 SFXN5-214ENST00000482289 895 ntTSL 1 (best)21.44■■□□□ 1.027e-16■■■■■ 185.9
UTP3Q9NQZ2 SFXN5-215ENST00000482542 546 ntTSL 414.84□□□□□ -0.037e-16■■■■■ 185.9
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 185.8
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 39.49□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 185.6
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 517.9■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 185.4
UTP3Q9NQZ2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 185.4
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 218.08■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 185.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.946e-10■■■■■ 185.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.746e-10■■■■■ 185.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2E1-211ENST00000495141 582 ntTSL 217.26■□□□□ 0.356e-10■■■■■ 185.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 220.64■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 185
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 417.9■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 185
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 185
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 410.56□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 185
UTP3Q9NQZ2 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 185
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-205ENST00000520623 1923 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 184.8
UTP3Q9NQZ2 EPHX2-208ENST00000521684 935 ntTSL 316.25■□□□□ 0.191e-9■■■■■ 184.8
UTP3Q9NQZ2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-24■■■■■ 184.8
UTP3Q9NQZ2 ERICH1-207ENST00000522893 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.084e-24■■■■■ 184.8
UTP3Q9NQZ2 IMMP2L-208ENST00000487733 580 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-9■■■■■ 184.8
UTP3Q9NQZ2 EIF4G2-224ENST00000532349 550 ntTSL 25.56□□□□□ -1.524e-24■■■■■ 184.8
UTP3Q9NQZ2 WWP2-207ENST00000566463 1971 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 184.7
UTP3Q9NQZ2 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 184.7
UTP3Q9NQZ2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 184.6
UTP3Q9NQZ2 MIGA2-208ENST00000474639 585 ntTSL 417.07■□□□□ 0.321e-9■■■■■ 184.3
UTP3Q9NQZ2 TULP4-204ENST00000613390 804 ntTSL 517.34■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 184.3
UTP3Q9NQZ2 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 184.2
UTP3Q9NQZ2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 184.1
UTP3Q9NQZ2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 184.1
UTP3Q9NQZ2 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 184.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 184.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 184.1
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 221.74■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 420.37■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 416.33■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 416.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 313.09□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.356e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.056e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-206ENST00000586797 1615 ntTSL 518.27■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.56e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-12■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 184
UTP3Q9NQZ2 JUND-202ENST00000600972 500 ntTSL 227.43■■□□□ 1.981e-13■■■■■ 183.6
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 183.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 572.1 ms