Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A4GALTQ9NPC4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms