Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNG6Q9BXT2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNG6Q9BXT2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms