Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSCC1Q9BVC3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSCC1Q9BVC3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms