Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR3CQ9BUI4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLR3CQ9BUI4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms