Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM79Q9BSE2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM79Q9BSE2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM79Q9BSE2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms