Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LPIN3Q9BQK8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LPIN3Q9BQK8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms