Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC9Q96Q05 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms