Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms