Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAMP1Q96JM3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms