Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CPNE2Q96FN4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms