Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX11Q96FC9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms