Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSMEM1Q8WWF3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms