Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC12Q8WUD4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC12Q8WUD4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms