Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PIK3C3Q8NEB9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms