Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNMB4Q86W47 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms