Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms