Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL35Q6PF15 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms