Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRNP1Q6NT89 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms