Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM41BQ5BJD5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM41BQ5BJD5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms