Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF1Q3BBV0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF1Q3BBV0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms