Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK3Q16288 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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