Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RABEP1Q15276 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABEP1Q15276 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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