Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LAPTM4AQ15012 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LAPTM4AQ15012 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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