Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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