Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms