Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ODF1Q14990 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ODF1Q14990 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ODF1Q14990 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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ODF1Q14990 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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