Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBA3CQ13748 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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