Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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