Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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MTMR3Q13615 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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MTMR3Q13615 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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MTMR3Q13615 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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MTMR3Q13615 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MTMR3Q13615 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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