Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGDRQ13258 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDRQ13258 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms