Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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