Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABPB1Q06547 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABPB1Q06547 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms